Diesmal steht nicht nur die Welt auf dem Spiel - es geht außerdem um die Familienehre! Schlimm genug, dass die mysteriösen Magna-Men eine äußerst gefährliche Geheimwaffe geklaut haben. Doch dann wird auch noch der zwielichtige Donnagon statt Gregorio Cortez (Antonio Banderas) als neuer Chef der 'OSS' ernannt. Als erste Amtshandlung setzt dieser seine Kinder als neue Nr. 1 'Spy Kids' auf die Magna-Men an. Carmen (Alexa PenaVega) und Juni Cortez (Daryl Sabara) lassen sich das natürlich nicht gefallen und so verschlägt es die beiden Geschwister auf eine verwunschene Insel voller erstaunlicher Wesen und tückischen Gefahren.
This time, it's not just the world that is at stake - it's also about family honor! It's bad enough that the mysterious Magna-Men have stolen an extremely dangerous secret weapon. But then the shady Donnagon is appointed as the new head of the 'OSS' instead of Gregorio Cortez (Antonio Banderas). As his first official act, he sets his children on the Magna-Men as the new No. 1 'Spy Kids'. Of course, Carmen (Alexa PenaVega) and Juni Cortez (Daryl Sabara) don't put up with this and so the two siblings end up on an enchanted island full of amazing creatures and treacherous dangers.