Im Jahre 2065: eine verwüstete Erde, auf der nur wenige Lebensformen existieren können. Eine Invasion von Außerirdischen droht auch den letzten Rest der Menschheit und jegliches weitere Leben auszulöschen. Es gibt nur eine Hoffnung, das Schicksal aller zu retten und die Eroberer zu eliminieren: die Wissenschaftlerin Aki Ross. Mit Hilfe ihres Mentors Dr. Sid und der Kampftruppe 'Deep Eyes' sucht sie nach den letzten Überresten der Schlüsselkomponenten, die die Erde retten könnten. Ein Rennen gegen die Zeit beginnt - und gegen den militanten General Hein, der die einzig mögliche Chance darin sieht, eine riesige Space-Kanone auf die Feinde abzufeuern.
In the year 2065: a devastated earth on which only a few life forms can exist. An alien invasion threatens to wipe out the last remnants of humanity and all further life. There is only one hope to save everyone's fate and eliminate the conquerors: the scientist Aki Ross. With the help of her mentor Dr. Sid and the 'Deep Eyes' fighting group, she searches for the last remnants of the key components that could save Earth. A race against time begins - and against the militant General Hein, who sees the only possible chance in firing a huge space cannon at the enemies.