Auch in der dritten Staffel muss Wissenschaftlerin Dr. Helen Magnus (Amanda Tapping) und ihr 'Sanctuary' Team wieder bizarre Kreaturen und andere übersinnliche Wesen retten. Als ihr geschätzter Kollege Will Zimmerman (Robin Dunne) selbst zu einer anormalen Kreatur mutiert und für grenzenlose Verwüstung sorgt, ist das ganze Team in heller Aufruhr, um eine globale Katastrophe zu verhindern. Als die Gefahr gebannt und Will wieder unter Kontrolle ist, erhalten die Wissenschaftler den Hinweis, dass in einem Bankschließfach das Ei eines mysteriösen Wesens hinterlegt sei. Das Team macht sich umgehend auf den Weg, doch die Kreatur ist bereits geschlüpft und braucht dringend einen menschlichen Wirt...
Im zweiten Teil der dritten Staffel kämpft das 'Sanctuary' Team an vielen Fronten. In 'Hohlerde' bekriegen sie weiterhin die Tyrannin Ranna Seneschal (Polly Walker) und stoßen bei der Untersuchung einer alten Burg in Praxis zudem auf die herrschsüchtige Vampirkönigin Afina (Aliyah O'Brien). Im Sanctuary-Lager hingegen herrscht der Ausnahmezustand. Alle gefangenen Wesen sind verschwunden und das Lager ist verwüstet. Als Dr. Magnus den verschwundenen Henry dort auffindet, kann dieser sich jedoch an nichts erinnern.
Die komplette 3. Staffel mit den folgenden Episoden:
01. Ein guter Tag zum Sterben
02. Brandmauer
03. Banküberfall
04. Blutspur
05. Magische Kräfte
06. Animus
07. Warnung aus der Unterwelt
08. Für König und Vaterland
09. Totenmesse
10. Tor zur Hölle
11. Römischer Friede
12. Blackout
13. Das Geisterschiff
14. Metamorphose
15. Geplatztes Dinner
16. Kalmins Thron
17. Normandie
18. Gefangen in der Zeit
19. Das andere Leben
20. Zurück in die Dunkelheit
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