'Ein Werk Gottes' erzählt die bewegende Geschichte zweier Männer, die den Konventionen ihrer Zeit trotzten, um die Medizin zu revolutionieren. In den 1940er Jahren, als Rassentrennung und Diskriminierung im amerikanischen Süden an der Tagesordnung waren, arbeiteten Dr. Alfred Blalock (Alan Rickman) und Labor-Techniker Vivien Thomas (Mos Def) in Baltimore gemeinsam an einer völlig neuartigen Methode, um 'blaue Babys' am Herzen zu operieren. Im Wettlauf gegen die Zeit bemühen sie sich fieberhaft, ein sterbendes Kleinkind zu retten, wobei sie ihre gesellschaftlich völlig unterschiedliche Herkunft überwinden. Blalock ist der wohlhabende weiße Chefchirurg des Johns-Hopkins-Hospital, Thomas ist schwarz und arm, ein fähiger Tischler. Blalock und Thomas erfinden eine neue medizinische Disziplin und retten damit tausenden von Patienten das Leben. Doch der gesellschaftliche Druck behindert ihre Teamarbeit und droht ihre Freundschaft zu zerstören.